۱۸ بهمن ۱۴۰۴
به روز شده در: ۱۸ بهمن ۱۴۰۴ - ۰۷:۲۱
فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
اکنون باید به تولید مثل در فضا فکر کنیم! ترامپ: مذاکرات بسیار خوب بود ؛ اگر ایرانی ها همین پیشنهادها را قبلاً داده بودند، بلافاصله قبول می کردیم/ تهران مشتاق توافق است و من هم دیپلماسی را ترجیح می دهم/ هفته بعد باز هم مذاکره می کنیم روز هفتم جشنواره فجر چهل و چهارم در سینما رسانه ؛ فیلم‌ها و حاشیه‌ها (+عکس) تنها مونس هنرپیشه مشهور، موش موش بود تهمت بی غیرتی به هنرپیشه مشهور انتشار اولین آرای مردمی جشنواره فیلم فجر علت جدایی تام کروز و آنا د آرماس لو رفت؟/ خانم بازیگر وفادار نبود؟ بیانیه انجمن جامعه‌شناسی ایران درباره محکومیت دکتر مهرآیین النصر بازهم در غیاب کریستیانو رونالدو پیروز شد  ابراز امیدواری اردن از مذاکرات ایران و آمریکا انصارالله: رد پای آمریکا در انفجار تروریستی پاکستان آشکار است بالاخره قهوه برای گوارش خوب است یا بد؟ استقبال دبیرکل شورای همکاری خلیج فارس از گفت‌وگوهای ایران و آمریکا آتش‌ سوزی کارگاه چوب‌بری داخل پادگان شماره۲ سماجا تهران (+عکس) استوری تلگرام برای کاربران ایرانی فعال شد